@phdthesis{Wierschin2015, author = {Torsten Wierschin}, title = {Graphical Models for Protein-Protein Interaction Interface Prediction}, journal = {Graphische Modelle zur Vorhersagen von Protein-Protein Wechselwirkungsstellen}, url = {https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:9-002257-4}, year = {2015}, abstract = {In der Dissertation werden ein CRF-Ansatz und dessen Umsetzung vorgestellt, um die Interaktionswechselwirkungsstellen in Proteinhomodimeren und Proteinheterodimeren vorherzusagen. Dabei wird die r{\"a}umliche Struktur der beteiligten Proteine benutzt. Das Verfahren umfasst ein im Wesentlichen einfaches Kantenmerkmal. Eine neuartige Knoten-Featureklasse wird eingef{\"u}hrt: die {\"A}nderung der Freien Energie. Der Online-Large Margin-Algorithmus wird angepasst, um die Modellparameter anhand einer klassifizierten Referenzstichprobe anzulernen. Eine deutlich h{\"o}here Vorhersagegenauigkeit wird durch die Kombination der neuen Knoten-Featureklasse mit der Standard-Knoten-Featureklasse RASA -- die relative, zug{\"a}ngliche Oberfl{\"a}che -- erzielt. Die Qualit{\"a}t der Vorhersagen wird durch die Berechnung der Fl{\"a}che unter der ROC-Kurve gemessen.}, language = {en} }