@phdthesis{Hentschker2018,
  author    = {Christian Hentschker},
  title     = {Qualitative und quantitative Untersuchungen zu posttranslationalen Modifikationen bakterieller Proteome},
  journal    = {Qualitative and quantitative analyses of posttranslational modifications in bacterial proteomes},
  url       = {https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:9-002989-6},
  year      = {2018},
  abstract  = {Posttranslationale Proteinmodifikationen beeinflussen Proteinaktivit{\"a}ten und Signalwege innerhalb einer Zelle und haben somit vielf{\"a}ltige Auswirkungen auf den Stoffwechsel von Bakterien. Um die genauen Mechanismen besser verstehen zu k{\"o}nnen, wurde in dieser Arbeit das Phosphoproteom von Streptococcus pneumoniae D39 untersucht. Der Schwerpunkt lag dabei in der Entwicklung besserer Auswertestrategien und der damit einhergehenden verbesserten Identifizierung von Phosphoproteinen. Um dies zu bewerkstelligen, wurden die Proteinextrakte durch gelfreie und gelbasierte Methoden aufgetrennt. Die Auswertung der Experimente erfolgte zun{\"a}chst durch klassische Proteinidentifizierung mit Hilfe von Proteindatenbanken. Zus{\"a}tzlich wurden Spektrenbibliotheken von S. pneumoniae D39 aufgebaut und diese f{\"u}r eine bessere Proteinidentifizierung sowie Phosphoproteinidentifizierung genutzt. Anschlie{\"s}end wurden zur Quantifizierung des Phosphoproteoms dieses Pathogens verschiedene Quantifizierungsmethoden getestet und modifiziert. Hierbei wurde zum einen das Phosphoproteom einer Kinasedeletionsmutante von S. pneumoniae D39 {\"u}ber die Spotintensit{\"a}ten von 2D Gelen mit dem Wildtyp verglichen. Zus{\"a}tzlich wurden die Auswirkungen dieser Kinase auf das globale S. pneumoniae D39 Proteom mittels SILAC sowie der neu erstellten Spektrenbibliothek aufgezeigt. Eine weitere etablierte Quantifizierungsmethode f{\"u}r Phosphoproteine in der Arbeit war die Kombination von metabolischer Markierung und 2D Gelen. Die Ver{\"a}nderung des Phosphoproteoms wurde an dem industriell bedeutsamen Bakterium Bacillus pumilus anhand von oxidativem Stress aufgezeigt.},
  language  = {de}
}