@phdthesis{Liebeke2011, author = {Manuel Liebeke}, title = {Establishment and application of techniques for microbial metabolomics}, journal = {Entwicklung und Anwendung von Techniken f{\"u}r die Metabolomanalyse von Bakterien}, url = {https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:gbv:9-000881-7}, year = {2011}, abstract = {Mit der Entwicklung neuer Methoden in dem Feld der funktionellen Genomforschung ist es moeglich das Genome, Transkriptom, Proteom und Metabolom zu erfassen und damit werden tiefere Einblicke in zellulaere Prozesse moeglich. Unser Wissen ueber molekulare Zusammensetzungen vieler Organismen stieg hauptsaechlich wegen dieser Weiterentwicklung dramatisch an. Bis heute sind viele Organismen, inklusive pathogener Bakterien sequenziert und machen den Weg frei fuer Metabolische-Netzwerk Konstruktionen. Das Interesse an Metabolomics, dem globalen Profiling von Metaboliten einer Zelle, einem Gewebe oder eines ganzen Organismus ist in letzter Zeit stark angestiegen. Eine Vielzahl an analytischen Techniken, wie Kernspinresonanz (NMR) Spektroskopie, Gaschromatographie-Massenspektrometrie (GC-MS), Fluessigchromatographie-Massenspektrometrie (LC-MS), Fourier-Transformations Massenspektrometrie (FT-MS) werden benoetigt um die Anzahl aller erfassbaren Metabolite in einer Probenmatrix zu erhoehen. Mit der Hilfe von ‘Microbial Metabolomics’, also der Identifizierung und Quantifizierung einer grossen Vielzahl von Metaboliten eines Bakteriums wird die Entschluesselung des bakteriellen Stoffwechsels moeglich. Die Arbeitsschritte zur Analyse eines Metabolomes beinhalten die Prozesse der (i) Probengenerierung und Vorbereitung, (ii) Entwicklung geeigneter Analysenmethoden, (iii) Aufnahme von analytischen Roh-Daten und deren Vorprozessierung, (iv) eine Datenanalyse und (v) eine Datenintegration in die angewendete biologische Fragestellung. Die vorliegende Arbeit gibt Einblicke in die oben genannten Prozesse einer Metabolomanalyse. Ein spezieller Fokus wurde dabei auf die Analyse von Exo- und Endometabolom Gram-positiver Bakterien gesetzt.}, language = {en} }