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Mathematical Modeling of Microarray Experiments

  • Diese Arbeit beschäftigt sich mit der Analyse und Modellierung des Microarrayexperiments. Hierfür wird das gesamte Experiment in fünf Teilprozesse zerlegt, die Reverse Transkription, die Hybridisierung, das Waschen, die Fluoreszenz und die Detektion. Jeder Teilprozess wurde separat modelliert und analysiert. Anschließend wurde die Teilprozesse im Gesamtmodell vereint und dieses für verschiedene Parametersituationen simuliert. Diese Arbeit ermöglicht eine mathematische Handhabung des Microarrayexperiments und deckt seine Abhängigkeit von den einzelnen Schritten des Experiments auf. Dies kann benutzt werden, um Normalisierung und Analyse zu verbessern.
  • This work deals with the analysis and modeling of microarray experiments. Therefor, the entire experiment is devided into five subprocesses, i.e. reverse transcription, hybridization, washing, fluorescence and detection. Each subrocess was modeled and analyzed separately. Afterwards the subrocesses were merged into the compound model, which was simulated for different parameter situations. This work enables a mathematical handling of the microarray experiment and helps to reveal its dependencies on the experimental steps. This can be used to improve the normalization and the analysis of microarray data.

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Metadaten
Author: Robert Bialowons
URN:urn:nbn:de:gbv:9-000841-0
Title Additional (German):Mathematische Modellierung von Microarrayexperimenten
Title Additional (English):Mathematical Modeling of Microarray Experiments
Advisor:Prof. Dr. Volkmar Liebscher
Document Type:Doctoral Thesis
Language:German
Date of Publication (online):2010/09/10
Granting Institution:Ernst-Moritz-Arndt-Universität, Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät (bis 31.05.2018)
Date of final exam:2010/08/31
Release Date:2010/09/10
Tag:Hybridisierung; Microarray; Modellierung
hybridization; microarray; modeling
GND Keyword:Microarray; Modellierung; Hybridisierung
Faculties:Mathematisch-Naturwissenschaftliche Fakultät / Institut für Mathematik und Informatik
DDC class:500 Naturwissenschaften und Mathematik / 510 Mathematik