Refine
Document Type
- Article (1)
- Doctoral Thesis (1)
Has Fulltext
- yes (2) (remove)
Is part of the Bibliography
- no (2)
Keywords
- Mecklenburg-Western Pomerania (2) (remove)
Institute
Publisher
- Taylor & Francis (1)
Global and even national genome surveillance approaches do not provide the resolution necessary for rapid and accurate direct response by local public health authorities. Hence, a regional network of microbiological laboratories in collaboration with the health departments of all districts of the German federal state of Mecklenburg-Western Pomerania (M-V) was formed to investigate the regional molecular epidemiology of circulating SARS-CoV-2 lineages between 11/2020 and 03/2022. More than 4750 samples from all M-V counties were sequenced using Illumina and Nanopore technologies. Overall, 3493 (73.5%) sequences fulfilled quality criteria for time-resolved and/or spatially-resolved maximum likelihood phylogenic analyses and k-mean/ median clustering (KMC). We identified 116 different Pangolin virus lineages that can be assigned to 16 Nextstrain clades. The ten most frequently detected virus lineages belonged to B.1.1.7, AY.122, AY.43, BA.1, B.1.617.2, BA.1.1, AY.9.2, AY.4, P.1 and AY.126. Time-resolved phylogenetic analyses showed the occurrence of virus clades as determined worldwide, but with a substantial delay of one to two months. Further spatio-temporal phylogenetic analyses revealed a regional outbreak of a Gamma variant limited to western M-V counties. Finally, KMC elucidated a successive introduction of the various virus lineages into M-V, possibly triggered by vacation periods with increased (inter-) national travel activities. The COVID-19 pandemic in M-V was shaped by a combination of several SARS-CoV-2 introductions, lockdown measures, restrictive quarantine of patients and the lineage specific replication rate. Complementing global and national surveillance, regional surveillance adds value by providing a higher level of surveillance resolution tailored to local health authorities.
Das Gezeter des Seggenrohrsängers, die Alarmrufe der Uferschnepfe, das Gemecker der Bekassine, das Geschnarre des Wachtelkönigs und die Pfiffe des Tüpfelsumpfhuhns - kaum ein anderer Lebensraum weist so viele exklusive Vogelarten auf wie die Flusstalmoore. Dieser Moortyp dominiert die Grundmoränenlandschaft des südlichen Ostseeraumes. Jedoch wurde auch kein anderer Lebensraum vom Menschen so gründlich in seiner ökologischen Funktionstüchtigkeit gestört. Insbesondere die grossflächigen und tief gehenden Entwässerungen des 20. Jahrhunderts führten zum Verstummen zahlreicher Vogelarten. So ist etwa der Seggenrohrsänger heute vom globalen Aussterben bedroht. In Nordostdeutschland wurden in den letzten 15 Jahren grosse Anstrengungen unternommen, die Ökosystemleistungen der Flusstalmoore neu zu beleben. Dazu wurden über 20 000 Hektar Moorfläche wiedervernässt. Wie reagiert die Vogelwelt auf diese neuen Veränderungen? Bestehen Chancen für eine Wiederansiedlung verschollener Vogelarten? Wie können die Wiedervernässungsmassnahmen gestaltet werden, um gefährdete Vogelarten zu begünstigen? Lässt sich das Leitbild des Artenschutzes mit den Leitbildern des Moor- und Klimaschutzes und zukünftigen Bewirtschaftungsformen vereinen? Diesen Fragen ist der Autor in einer umfassenden Studie von Vogelwelt, Vegetation und Hydrologie am Beispiel des Peene- und Trebeltals in Mecklenburg-Vorpommern nachgegangen und stellt seine Ergebnisse hier vor.